W szkole działa Rada Pedagogiczna Szkoły Podstawowej w Zespole Szkół nr 3 im. Jana Pawła II w Krzyżoweji. Kompetencje Rady Pedagogiczne określa art. 70 ustawy Prawo oświatowe oraz Statut szkoły.
W skład Rady Pedagogicznej wchodzą:
- dyrektor szkoły
- nauczyciele
mgr Agata Janczyk
mgr Agnieszka Kubica
mgr Agnieszka Marszałek-Sobel
mgr Alicja Urbaniec
mgr Anna Wyleciał
mgr Bożena Niewdana
mgr Dariusz Pawełek
mgr inż. Ewa Lach
mgr Iwona Stolarczyk
mgr Józef Hubka
mgr Józef Widz
mgr inż. Magdalena Szumlas-Wiewióra
mgr Marian Makuch
mgr Mirosław Mętel